崇祯点头，还真有！
陈舟回到登莱以后，把毛文龙一事上书报告皇帝，奏章末尾说：“毛文龙作为大将，不是臣可以擅自诛杀的，所以臣请陛下降罪。”
“降罪虽然也是陛下的权利，但是又不能真的降罪，既然如此，陛下不妨就大加表彰他，把那毛文龙之罪宣告天下，说明是陛下的旨意！”
崇祯大喜，果然不愧是东林智囊啊，这样一来，那毛文龙恶名昭著，诛杀他的名声，就到了自己的身上了，也不会给陈舟带来什么好处。
当然这一下陈舟的罪名也就相应减轻了，可是本来就没有办法治他的罪，只能如此。
旨意到了登莱，陈舟自然是胸有成竹，可是登莱的官员却是大吃一惊，想着多少得怪罪一番，没想到却是褒扬的旨意。
崇祯不仅以赞扬的态度下诏书褒奖陈舟，还在不久之后又传旨公开毛文龙的罪行，用以稳定辽东军民的心，连毛文龙埋伏在京城的人，也命令法司搜捕关押。
陈舟一看，这依然是历史的轨迹，就又上书说：“毛文龙一介匹夫，不守法竟至于此，皆因海外便于作乱——他的部队连老带幼一起算有四万七千人，假称十万，并且中间有很多百姓，兵还不到两万，擅自设将领千人。现在不便于再设总帅，就以陈继盛和其子代行其事，也算便宜行事。”
这次的奏章，又让崇祯皱起了眉头！
毛文龙死了，让他的部将和儿子继续镇守，这合适吗？
左光斗笑道：“陛下，所谓恩出于上，只要陛下下旨任命，有何不可，兵部不过是走走手续罢了！”
崇祯点头又摇头：“左卿家说的虽是，可是这陈舟身为兵部尚书，又兼任蓟辽总督，由上而下，一以贯之，不妥！”
左光斗一笑：“这又有何难，毛文龙已死，平辽将军之位可以授予其子，以安其心——袁崇焕尚在，陛下可以让袁崇焕来担任蓟辽总督这个职位！”
崇祯大喜，可是又有些担忧道：“那陈舟尚在辽东，若是撤了蓟辽总督，怕是有些不满！”
“这却不难，只要将他调离辽东不就好了！”
“可是，陈舟身为兵部尚书，巡狩辽东正是其职责所在，如何将其调离？”
“陛下忘记了，前些时日，那陕绥上的折子了么？”
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