不过宇智波鼬也提出了留下弟弟佐助的要求，团藏坚决反对，无奈日斩再一次心软了，于是团藏退求其次，要求将佐助交给根培养，当然，这个要求再一次被拒绝了。
好在失望的次数多了，团藏早就麻木了。正好，他当时还有别的事情处理，不过是个没开眼的宇智波，翻不出多大的风浪来，而且退一步想，木叶确实需要给外界一个我们不会亏待遗孤的态度来，所以团藏罕见地没有在这件事上过多的纠缠。
因为有了卡卡西的案例在前，团藏尝试着将止水的眼睛移植到了自己的右眼，这才明白写轮眼对外姓之人来说根本就是个负担，不过无所谓，他有初代的细胞在手，不怕有负担。所以在灭族之后，团藏抢在暗部之前打扫了战场，悄悄地留下了数对三勾玉的写轮眼，因为大蛇丸这些年跟他还有往来，并承诺只要他能弄来写轮眼，就有办法给他装上。
在把写轮眼送给大蛇丸之后，大蛇丸送来了一个布满了写轮眼的手臂，并将它移植到了自己的右臂上，之后，团藏在手臂的外部布下牢固的封印，果然，谁都不知道他做了什么。
大蛇丸再次找上门来要求合作的时候，团藏心动了，除掉了三代，火影舍他其谁？所以在中忍考试的时候，团藏下令根部按兵不动，结果自然不出他所料，日斩对着昔日的弟子，到底还是心软了，终是赔上了自己的性命。
可惜，五代还是不是他，因为自来也的游说，大名和顾问团选择了有着初代血脉的纲手姬。
忍无可忍的团藏让纲手二选一，说吧，你要保人柱力还是宇智波遗孤？
然而没等纲手作出选择，部下来报：宇智波佐助叛逃，投奔大蛇丸啦。
好你个大蛇丸，居然留了一手！
要说佐助叛逃这事里面没有大蛇丸的影子，团藏一百个不信！
因为宇智波佐助跑了，纲手姬自然不会同意将四代的血脉交由根部培养，自来也就更绝了，直接来了个釜底抽薪，以探察晓的踪迹为由，打着出门采风的旗号，带着鸣人出村了，等团藏得到消息的时候，人早就跑的无影无踪啦，于是团藏除了跳脚居然无计可施。
人柱力和宇智波遗孤都不在了，团藏只得蛰伏起来，耐心的等待下一次机会，好在承天之佑，区区三年，晓终于从幕后走到了台前，各国人柱力一个接一个的被抓，然后团藏等待那个机会终于来了。
纲手姬在佩恩袭村的时候，因为查克拉枯竭，陷入了昏迷，这里面，自然也有团藏的一份功劳，虽然团藏说了是为了木叶的将来，但是实际上...呵呵！
谁知道大名居然属意卡卡西担任六代火影，好在那小子识相，拒绝了，团藏当即向大名“毛遂自荐”终于得偿心愿，得到了六代火影之位。
正好，雷之国大名提议召开五影大会，于是团藏选了两个根部的暗卫一路直奔铁之国。
山中风还有油女取根，这两人是团藏精心挑选出来的，算是团藏秘密培养的两张王牌，只是团藏没想到，还没到铁之国，王牌就折了一张。
不过是好好的在赶路，突然一声“下面的人快闪开！”，几人下意识地就开始闪躲，问题是，天下突然下起了番茄雨，取根一个脚滑，被从天而降的忍鹰压成了肉泥......
风倒是想帮好友报仇呢，可是那只鹰随即“嘭”的一声消失了，一看就知道是因为伤势太重，自动解除了通灵之术，跟着，天上就跳下个佐助来。
也是取根倒霉，坠机的时候，佐助刚好在伸手拿番茄，然后座驾一歪，人还没事，番茄先掉了一堆，接着就是精疲力尽的疾风掉了下来，好在疾风在下坠之前提醒过佐助当前高度，所以佐助倒是没受伤，甚至因为感知到下面有人，还特地吼了一嗓子，但也仅止于此，佐助降落的时候，好死不死的步上了取根的前尘，于是....团藏不费吹灰之力就得到了宇智波遗孤一只。
本以为能得到万花筒一双，哪知道佐助他瞎了......
赔了夫人又折兵说的就是团藏现在的状态，要不是打着用佐助来威胁到鼬的主意，团藏早就杀人泄愤了。
用根部特有的封印术封印了佐助的查克拉，团藏按计划参加了五影大会，然而团藏的好运大概是在成为火影的时候用尽了，他才刚用写轮眼控制了三船企图让自己成为领头人，“斑”就大闹了五影大会不说，还宣布了要开启第四次忍界大战，搞得木叶一下子成为了众矢之的。
谁让宇智波斑出身木叶呢，更何况团藏还带着宇智波佐助，他拿佐助当俘虏，可是别人不知道啊，尤其是雷影，看到宇智波鼬的弟弟，当场就要杀了佐助给八尾报仇，团藏除了只来得及在心里感慨一声，除了木叶居然还有别的忍村玩“温情”着一套，接下来时间就是应付雷影的胡搅蛮缠了。
可以说，在某种程度上，“斑”的出现反而给他解围了，虽然团藏一点都不感激“斑”。
五影大会因为“斑”的出现变得一团糟，既然这场会议已经没有意义了，团藏也无心纠缠，带着佐助就打算打道回府。
不然呢？
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